MacVector

macOS 原生桌面序列分析軟體
超過 35 年持續開發的分子生物學完整工具套件

MacVector 是領先的 macOS 桌面序列分析應用程式，專為分子生物學家設計，用於分析、操作、組裝和記錄 DNA 及蛋白質序列。最早於 1980 年代末期由 International Biotechnologies, Inc.（IBI）開發，持續發展超過 35 年，是現存歷史最悠久的生物資訊學應用程式之一。

MacVector 提供全面的一站式工具套件，涵蓋從引子設計和選殖模擬，到限制酶分析和質體圖譜繪製，再到序列組裝（Sanger、NGS 和長讀段）、蛋白質分析和系統發生樹建構。該應用程式設計為功能強大且直覺化，讓實驗台科學家無需命令列技能或生物資訊學專業知識即可執行複雜的生物資訊學任務。

MacVector 的關鍵差異化因素是其原生 macOS 開發 — 以真正的 Cocoa 應用程式構建，使用 Apple 的框架，提供反應迅速、穩定、Mac 原生的使用者體驗。軟體完全離線運行（無雲端依賴），保護專有序列並支援氣隙實驗室環境。自 2024 年 9 月起，MacVector 免費包含 Assembler 工具套件，提供六個從頭組裝器和兩個參考序列映射工具，支援所有定序平台。

產品資訊

開發商	MacVector, Inc. — 美國北卡羅來納州 Apex（總部）+ 英國劍橋（歐洲辦事處）
平台	僅限 macOS（原生 Cocoa 應用程式）
最新版本	MacVector 18.8.2（2025 年 10 月）
授權模式	永久授權（可選維護續約）或年度訂閱
免費版本	MacVector Free（檢視、編輯、基本檔案操作）

核心功能

序列編輯與視覺化

豐富的序列編輯器

可自訂的特徵顯示（顏色、箭頭、標籤），支援即時特徵註釋和編輯

互動式圖譜檢視

環狀和線性圖譜檢視，適用於質體和線性 DNA，支援出版品質的向量圖形匯出

密碼子使用表檢視器

密碼子使用分析和最佳化，支援反向轉譯和 mRNA 結構生成

MacVector 序列編輯器與互動式圖譜檢視

選殖與建構設計

Click Cloning

拖放式介面進行限制酶選殖，Cloning Clipboard 記錄所有連接事件，包含使用的酵素和日期

Gibson Assembly / LIC

Gibson 組裝和連接酶非依賴性選殖（LIC）的自動化平衡引子生成

Gateway、TOPO 及 In-Fusion 選殖

支援 Invitrogen Gateway、TOPO TA、Zero Blunt 和 Takara/Clontech In-Fusion 技術

模擬瓊脂糖凝膠

逼真的限制酶切消化模擬，可調整瓊脂糖濃度和電泳時間

MacVector Click Cloning 拖放式選殖介面

引子設計與分析

QuickTest Primer

即時互動式引子設計，附二級結構預覽，支援引子資料庫跨專案儲存和掃描

完整引子分析

Tm 計算、GC 含量、自身互補性分析、引子對最佳化，並可將限制酶切位引入引子

序列組裝（Assembler — 自 2024 年 9 月起內建）

從頭組裝器

Velvet（NGS）、phrap（Sanger）及其他共 6 個組裝器，支援 Sanger、Illumina、454、SOLiD、Helicos、Ion Torrent、PacBio、Oxford Nanopore

參考序列組裝

Bowtie2（NGS）、minimap2（長讀段），支援互動式讀段比對，含 SNP/INDEL 偵測和 CRISPR 驗證

組裝專案管理

Assembly Projects Manager、載體修剪（cross_match）、重疊群編輯、cDNA 比對、基因體完成和缺口封閉工具

MacVector Align to Reference 參考序列比對功能

序列搜尋

BLAST 與 Entrez

本地和遠端 NCBI BLAST 搜尋，直接查詢 NCBI 資料庫

限制酶與 ORF 搜尋

完整限制酶資料庫搜尋、ORF（開放閱讀框架）識別、基序搜尋和模式匹配

多重序列分析

多重序列比對

ClustalW、MUSCLE、T-Coffee 比對演算法，含 MSA 編輯器和共識序列產生

Dot Plot 與批次掃描

最佳化用於細菌基因體比較的 Dot Plot，以及 Align to Folder 大型資料集批次掃描

系統發生分析

系統發生樹建構

從比對建構系統發生樹，多種建樹方法，互動式樹狀圖視覺化和編輯，含 Bootstrap 分析

蛋白質分析

InterProScan 整合

結構域/家族識別，附圖形化結構域架構顯示，直接在蛋白質上註釋功能域

蛋白質結構與性質分析

二級結構預測、疏水性和抗原性圖譜、訊號肽預測、分子量和等電點計算

MacVector InterProScan 蛋白質結構域分析

技術規格

作業系統	僅限 macOS（原生 Cocoa 應用程式）；支援當前 macOS 版本
架構	64 位元（自 MacVector 14 起）
執行環境	完全離線 — 核心功能無需網路連線
安裝方式	標準 macOS .app 套件
授權啟動	序號 + 啟動碼（標準版）或硬體綁定（個人版）

支援的檔案格式

匯入格式	GenBank、EMBL、FASTA、FASTQ、SnapGene（.dna）、SerialCloner（.xdna）、SAM/BAM、BED、GFF/GFF3/GTF、PHYLIP、NEXUS 等
匯出格式	GenBank、EMBL、FASTA、PHYLIP、NEXUS 等；向量圖形（PDF、EPS）用於出版品質圖片
定序平台	Sanger、Illumina、454、SOLiD、Helicos、Ion Torrent、PacBio、Oxford Nanopore

公司歷史

年份	事件
1980 年代末	由 International Biotechnologies, Inc.（IBI）開發
1990 年代初	IBI 被 Eastman Kodak 公司收購；MacVector 繼續開發
1996 年	被 Oxford Molecular Group 收購
2001 年	Oxford Molecular 併入 Accelrys
2007 年	Dr. Kevin Kendall 成立 MacVector, Inc. 獨立開發和銷售
2025 年	MacVector 18.8.2 發布；持續開發超過 35 年

應用領域

分子選殖

限制酶選殖、Gibson Assembly、Gateway/TOPO、In-Fusion — 完整的選殖規劃和模擬工具。

引子設計與質體圖譜

PCR 引子最佳化、突變引子、定序引子設計；互動式環狀/線性圖譜建立，出版品質輸出。

序列確認與 CRISPR 驗證

將 Sanger 定序讀段比對至參考序列進行選殖驗證，使用 Align to Reference 偵測 CRISPR 編輯和 INDEL。

NGS 資料組裝

短讀段和長讀段的從頭組裝和參考序列組裝，支援所有主要定序平台。

蛋白質分析與系統發生學

結構域識別、結構預測、序列註釋，以及演化分析和樹狀圖建構。

序列記錄

實驗室筆記品質的選殖實驗記錄，Cloning Clipboard 自動記錄日期、酵素和末端修飾。

差異化優勢

原生 macOS 應用程式

唯一以真正原生 macOS 應用程式構建的主要序列分析軟體，反應迅速、穩定、Mac 最佳化 UI

完全離線運行

無雲端依賴，核心功能無需網路連線，保護專有序列並支援氣隙實驗室環境

全功能整合 + Assembler 內建

單一應用程式涵蓋選殖、引子設計、組裝、蛋白質分析、系統發生。自 2024 年 9 月起 Assembler 免費包含

永久授權 + 35 年以上持續開發

提供永久授權選項（非僅訂閱制），授權永不過期。為實驗台科學家設計，無需生物資訊專業知識

長讀段定序支援

透過 minimap2 支援 PacBio 和 Oxford Nanopore 組裝和參考映射

目標使用者

學術研究

分子生物學家、遺傳學家、基因體學研究人員、研究生和博士後研究員，以及學術研究實驗室。

產業與政府

製藥和生物科技研發團隊、臨床研究實驗室、政府研究機構（如 NIH、NCI 等）。

全球知名機構

Harvard、Stanford、UC Berkeley、NIH/NIAID、Massachusetts General Hospital、Max Delbruck Center 等機構廣泛使用。