MacVector

macOS 原生桌面串行分析软件
超过 35 年持续开发的分子生物学完整工具套件

MacVector 是领先的 macOS 桌面串行分析应用程序，专为分子生物学家设计，用于分析、操作、组装和记录 DNA 及蛋白质串行。最早于 1980 年代末期由 International Biotechnologies, Inc.（IBI）开发，持续发展超过 35 年，是现存历史最悠久的生物信息学应用程序之一。

MacVector 提供全面的一站式工具套件，涵盖从引子设计和选殖仿真，到限制酶分析和质体图谱绘制，再到串行组装（Sanger、NGS 和长读段）、蛋白质分析和系统发生树建构。该应用编程为功能强大且直觉化，让实验台科学家无需命令行技能或生物信息学专业知识即可运行复杂的生物信息学任务。

MacVector 的关键差异化因素是其原生 macOS 开发 — 以真正的 Cocoa 应用程序构建，使用 Apple 的框架，提供反应迅速、稳定、Mac 原生的用户体验。软件完全脱机运行（无云端依赖），保护专有串行并支持气隙实验室环境。自 2024 年 9 月起，MacVector 免费包含 Assembler 工具套件，提供六个从头组装器和两个参考串行映射工具，支持所有定序平台。

产品信息

开发商	MacVector, Inc. — 美国北卡罗来纳州 Apex（总部）+ 英国剑桥（欧洲办事处）
平台	仅限 macOS（原生 Cocoa 应用程序）
最新版本	MacVector 18.8.2（2025 年 10 月）
授权模式	永久授权（可选维护续约）或年度订阅
免费版本	MacVector Free（查看、编辑、基本文件操作）

内核功能

串行编辑与可视化

丰富的串行编辑器

可自订的特征显示（颜色、箭头、标签），支持即时特征注释和编辑

交互式图谱查看

环状和线性图谱查看，适用于质体和线性 DNA，支持出版品质的矢量图形导出

密码子使用表查看器

密码子使用分析和优化，支持反向转译和 mRNA 结构生成

MacVector 串行编辑器与交互式图谱查看

选殖与建构设计

Click Cloning

拖放式接口进行限制酶选殖，Cloning Clipboard 记录所有连接事件，包含使用的酵素和日期

Gibson Assembly / LIC

Gibson 组装和连接酶非依赖性选殖（LIC）的自动化平衡引子生成

Gateway、TOPO 及 In-Fusion 选殖

支持 Invitrogen Gateway、TOPO TA、Zero Blunt 和 Takara/Clontech In-Fusion 技术

仿真琼脂糖凝胶

逼真的限制酶切消化仿真，可调整琼脂糖浓度和电泳时间

MacVector Click Cloning 拖放式选殖接口

引子设计与分析

QuickTest Primer

即时交互式引子设计，附二级结构预览，支持引子数据库跨项目保存和扫描

完整引子分析

Tm 计算、GC 含量、自身互补性分析、引子对优化，并可将限制酶切位引入引子

串行组装（Assembler — 自 2024 年 9 月起内置）

从头组装器

Velvet（NGS）、phrap（Sanger）及其他共 6 个组装器，支持 Sanger、Illumina、454、SOLiD、Helicos、Ion Torrent、PacBio、Oxford Nanopore

参考串行组装

Bowtie2（NGS）、minimap2（长读段），支持交互式读段比对，含 SNP/INDEL 侦测和 CRISPR 验证

组装项目管理

Assembly Projects Manager、载体修剪（cross_match）、重叠群编辑、cDNA 比对、基因体完成和缺口封闭工具

MacVector Align to Reference 参考串行比对功能

串行搜索

BLAST 与 Entrez

本地和远程 NCBI BLAST 搜索，直接查找 NCBI 数据库

限制酶与 ORF 搜索

完整限制酶数据库搜索、ORF（开放阅读框架）识别、基序搜索和模式匹配

多重串行分析

多重串行比对

ClustalW、MUSCLE、T-Coffee 比对算法，含 MSA 编辑器和共识串行产生

Dot Plot 与批量扫描

优化用于细菌基因体比较的 Dot Plot，以及 Align to Folder 大型数据集批量扫描

系统发生分析

系统发生树建构

从比对建构系统发生树，多种建树方法，交互式树状图可视化和编辑，含 Bootstrap 分析

蛋白质分析

InterProScan 集成

结构域/家族识别，附图形化结构域架构显示，直接在蛋白质上注释功能域

蛋白质结构与性质分析

二级结构预测、疏水性和抗原性图谱、信号肽预测、分子量和等电点计算

MacVector InterProScan 蛋白质结构域分析

技术规格

操作系统	仅限 macOS（原生 Cocoa 应用程序）；支持当前 macOS 版本
架构	64 比特（自 MacVector 14 起）
运行环境	完全脱机 — 内核功能无需网络连接
安装方式	标准 macOS .app 套件
授权启动	序号 + 启动码（标准版）或硬件绑定（个人版）

支持的文件格式

导入格式	GenBank、EMBL、FASTA、FASTQ、SnapGene（.dna）、SerialCloner（.xdna）、SAM/BAM、BED、GFF/GFF3/GTF、PHYLIP、NEXUS 等
导出格式	GenBank、EMBL、FASTA、PHYLIP、NEXUS 等；矢量图形（PDF、EPS）用于出版品质图片
定序平台	Sanger、Illumina、454、SOLiD、Helicos、Ion Torrent、PacBio、Oxford Nanopore

公司历史

年份	事件
1980 年代末	由 International Biotechnologies, Inc.（IBI）开发
1990 年代初	IBI 被 Eastman Kodak 公司收购；MacVector 继续开发
1996 年	被 Oxford Molecular Group 收购
2001 年	Oxford Molecular 并入 Accelrys
2007 年	Dr. Kevin Kendall 成立 MacVector, Inc. 独立开发和销售
2025 年	MacVector 18.8.2 发布；持续开发超过 35 年

应用领域

分子选殖

限制酶选殖、Gibson Assembly、Gateway/TOPO、In-Fusion — 完整的选殖规划和仿真工具。

引子设计与质体图谱

PCR 引子优化、突变引子、定序引子设计；交互式环状/线性图谱创建，出版品质输出。

串行确认与 CRISPR 验证

将 Sanger 定序读段比对至参考串行进行选殖验证，使用 Align to Reference 侦测 CRISPR 编辑和 INDEL。

NGS 数据组装

短读段和长读段的从头组装和参考串行组装，支持所有主要定序平台。

蛋白质分析与系统发生学

结构域识别、结构预测、串行注释，以及演化分析和树状图建构。

串行记录

实验室笔记品质的选殖实验记录，Cloning Clipboard 自动记录日期、酵素和末端修饰。

差异化优势

原生 macOS 应用程序

唯一以真正原生 macOS 应用程序构建的主要串行分析软件，反应迅速、稳定、Mac 优化 UI

完全脱机运行

无云端依赖，内核功能无需网络连接，保护专有串行并支持气隙实验室环境

全功能集成 + Assembler 内置

单一应用程序涵盖选殖、引子设计、组装、蛋白质分析、系统发生。自 2024 年 9 月起 Assembler 免费包含

永久授权 + 35 年以上持续开发

提供永久授权选项（非仅订阅制），授权永不过期。为实验台科学家设计，无需生物信息专业知识

长读段定序支持

通过 minimap2 支持 PacBio 和 Oxford Nanopore 组装和参考映射

目标用户

学术研究

分子生物学家、遗传学家、基因体学研究人员、研究生和博士后研究员，以及学术研究实验室。

产业与政府

制药和生物科技研发团队、临床研究实验室、政府研究机构（如 NIH、NCI 等）。

全球知名机构

Harvard、Stanford、UC Berkeley、NIH/NIAID、Massachusetts General Hospital、Max Delbruck Center 等机构广泛使用。