MetaCore / MetaDrug
整合型人工編排知識資料庫暨路徑分析軟體套件 — 專為多組學實驗資料之路徑分析而設計
MetaCore 是科睿唯安旗下整合型人工編排知識資料庫暨路徑分析軟體套件，提供 100% 經人工編排與驗證的生物系統內容，包含以機轉、方向性和作用定義的分子交互作用，使研究人員能夠快速產生並驗證新型生物標記、藥物標靶和作用機轉的假設。
MetaCore 的底層知識庫 MetaBase 被譽為「當今市場上最全面的人工編排哺乳動物生物學資料庫」，也是市場上唯一同時具備方向性、機轉和作用三大交互作用屬性的資料庫。伴侶產品 MetaDrug 則提供系統藥理學解決方案，用於預測小分子化合物的代謝、毒性和生物效應。
MetaCore — 分析分子路徑並加速探索研究，涵蓋 2M+ 人工編排分子交互作用與 1,500+ 路徑圖
MetaBase 知識庫涵蓋範圍
分子交互作用
100% 經人工編排，每筆交互作用具備方向性、機轉和作用三大屬性 — 市場唯一
經典途徑圖
訊號傳遞與代謝途徑圖，搭配 1,100+ 經人工編排驗證的網絡
基因疾病關聯性
涵蓋 9,600+ 種疾病的基因-疾病關聯分析
化合物
具標靶與生物活性之化合物，搭配約 8,900 種藥物資料
代謝反應
含 5,300+ 種內源性代謝物，支援代謝體學分析
出版品參考資料
由博士和醫學博士研究專業人員（25 年以上經驗）持續策展更新
核心功能
路徑富集分析
將實驗資料對映至 1,500+ 經編排之經典途徑圖，使用超幾何分布進行統計富集。支援 GeneGo 途徑圖、GO 細胞過程、疾病生物標記網絡、藥物標靶網絡及毒性網絡等本體論富集
網絡分析
10+ 種網絡生成演算法，具組織、功能過程和物種特定篩選器。直接交互作用與最短路徑演算法，使用 G-scores 和 P-values 進行網絡評分，含 6 種互聯組工具
Key Pathway Advisor (KPA)
拖放式網頁應用程式，無需生物資訊學專業知識。預測關鍵蛋白質活性變化（根本原因分析），使用 SPIA 演算法，2 個步驟、1 分鐘內即可獲得結果
多組學資料整合
支援轉錄組學、蛋白質體學、代謝體學、基因體學、表觀基因體學及功能基因體學。通用解析器支援 Affymetrix、Agilent、Illumina 和 SNP 晶片格式
視覺化與自訂編輯
互動式經典途徑圖，Pathway Map Creator 用於繪製/編輯自訂途徑圖。所有功能皆可進行自訂網絡編輯，支援時序資料之動態圖形
100% 人工編排
所有交互作用皆由博士和醫學博士級專家人工編排並驗證。無 NLP 或自動化萃取，業界領先的本體論確保資料標註之一致性
MetaCore 路徑圖視覺化 — CD40 信號傳導路徑，涵蓋免疫反應、樹突細胞與巨噬細胞信號網絡
MetaDrug 伴侶產品
MetaDrug 是科睿唯安的系統藥理學解決方案，用於預測小分子化合物的代謝、毒性和生物效應。2007 年榮獲分子醫學會議最佳展示新產品獎。
代謝物預測
10,000+ 異源物質反應，80 種關鍵代謝反應規則
ADME/Tox 預測
40+ 個主要藥物代謝酵素之 QSAR 模型
活性預測
預測化合物及其代謝物之活性
脫靶效應
系統層級化學資訊學工具，結合化合物-標靶交互作用
適應症預測
預測新型小分子之潛在治療適應症
路徑整合
將預測結果與人體細胞訊號傳遞及代謝路徑整合
藥物開發生命週期涵蓋
| 階段 | MetaCore 能力 |
|---|---|
| 標靶探索 | 疾病-基因關聯分析（182K+）、基於網絡的標靶識別、互聯組分析 |
| 標靶驗證 | 路徑富集確認生物相關性、因果推理分析 |
| 先導化合物識別 | 化合物-標靶交互作用對映（750K+ 化合物）、透過 MetaDrug 預測脫靶效應 |
| 臨床前/安全性 | ADME/Tox 預測、毒理基因體學路徑分析、肝毒物評估 |
| 生物標記開發 | 貫穿開發週期的診斷性和預後性生物標記識別 |
| 藥物再定位 | 基於網絡識別現有藥物的新適應症（如 COVID-19 研究識別出 15 個藥物標靶及 46 種現有藥物） |
治療專業領域
腫瘤學
乳癌 GWAS、膠質母細胞瘤、卵巢癌、肝癌、慢性淋巴球性白血病
免疫學
免疫反應路徑富集、疫苗研究
感染性疾病
COVID-19 藥物再利用研究
罕見疾病
MetaMiner 囊性纖維化 — 首個疾病特異性軟體平台
毒理學
肝毒物研究、藥物誘發毒性評估
中樞神經系統
疾病本體論與經編排神經退化性疾病網絡
核心競爭優勢
唯一具備全部三項交互作用屬性
方向性、機轉、作用 — 市場上唯一同時具備這三大屬性的資料庫
100% 人工編排
無 NLP 或自動化萃取，所有交互作用由博士級專家驗證，確保最高數據品質
深度 ADME/Tox 整合
透過 MetaDrug 伴侶產品提供代謝物預測、安全性評估與適應症預測
Cortellis 生態系統整合
端對端藥物探索，與 CDDI、CCI 及其他 Cortellis 模組無縫整合，單一登入存取
適用產業與使用者
| 產業 | 主要應用場景 |
|---|---|
| 製藥公司 | 標靶篩選/驗證、生物標記識別、作用機轉研究、藥物再定位 |
| 生物技術公司 | 藥物探索路徑分析、先導化合物優化、轉譯研究 |
| 政府/監管機構 | 美國 FDA 授權使用 MetaCore 審查藥品申請中的基因體學資料 |
| 學術/研究機構 | 系統生物學研究、多組學分析（NIH、MIT、Yale、Stanford、Harvard 等） |
| 委託研究機構 | 為生技/製藥客戶提供基因體學服務 |
| 疾病基金會 | 疾病特異性平台開發（如囊性纖維化基金會） |
支援之輸入資料類型
| 資料類型 | 具體格式 |
|---|---|
| 轉錄組學 | Affymetrix、Agilent、Illumina（微陣列）；RNA-seq / NGS、SAGE、MPSS（定序） |
| 蛋白質體學 | 蛋白質表達資料、Co-IP pull-out |
| 代謝體學 | 代謝物列表，支援富集與路徑分析 |
| 基因體學 | SNPs、CGH 晶片、基因變異 |
| 表觀基因體學 | ChIP-seq 資料 |
| 功能基因體學 | RNAi 篩選、siRNA、microRNA |
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