AIDDISON

AIDDISON™ 是默克（Merck KGaA）推出的首款整合藥物發現與合成的 AI 解決方案（SaaS 平台），結合生成式 AI（REINVENT 4.0）、機器學習與電腦輔助藥物設計（CADD）工具，讓藥物化學家能在超過 600 億個化合物空間中，快速完成虛擬篩選、骨架跳躍、先導化合物鑑定與優化。平台基於超過 20 年經實驗驗證的製藥研發數據訓練，並透過 SYNTHIA™ 逆合成 API 即時評估分子的可合成性 — 業界唯一同時解決「設計什麼分子」與「如何合成」的一站式平台。

平台概覽

AIDDISON 平台架構總覽 — 整合生成式 AI、ADMET 預測、化學空間搜索、分子對接，並透過 SYNTHIA 逆合成 API 評估可合成性

AIDDISON 中實作的工作流程 — 包括分子生成、性質預測、虛擬篩選與逆合成評估等步驟

核心模組

模組	說明
De Novo 分子設計（REINVENT 4.0）	根據使用者定義的結構相似性和可合成性設計新型分子，優化 QED、ADMET 特性和結合親和力
ADMET 預測	預測藥物的吸收、分布、代謝、排泄、毒性性質
相似性與藥性搜尋	使用 BioSolveIT FPSim2 / FTrees 演算法搜尋超過 600 億化合物，包含 SA-Space 250 億+ 虛擬化合物
分子對接	使用 Cresset Flare 視覺化目標分子與蛋白質之間的交互作用，評估結合親和力
3D 形狀比對	使用 Cresset Flare 將 3D 分子結構對齊參考配體，進行骨架跳躍設計
SYNTHIA 逆合成	評估分子的可合成性，規劃合成路線

功能模組示意

De Novo 分子設計 — REINVENT 4.0 驅動的生成式 AI 分子生成

相似性與藥性搜尋 — 600 億+ 化合物空間快速篩選

3D 形狀比對 — Cresset Flare 分子結構對齊與骨架跳躍

分子對接 — 蛋白質配體複合物視覺化與結合評估

主要特色

整合 AI/ML 與 CADD 工具

將生成式模型、ADMET 性質預測、大型化學空間搜索與分子對接整合於單一平台，消除在多個工具之間切換的需求

600 億+ 化合物資料庫

從超過 600 億種化合物可能性中篩選，識別具有非毒性、溶解性、體內穩定性等關鍵藥物性質的候選分子

SYNTHIA 逆合成整合

最佳分子設計可直接送至 SYNTHIA 逆合成軟體，評估可合成性並找出所需試劑，橋接虛擬設計與實際製造 — 業界唯一

20 年以上實驗驗證數據

基於超過二十年的藥物研發實驗驗證數據集訓練，確保預測結果的可靠性，非僅從文獻或理論數據學習

安全合規的 Web 平台

符合 ISO 27001 標準，具備最高等級的數位產品資訊安全認證，用戶的研究數據和智慧財產得到嚴格保護

低學習門檻

介面簡潔，複雜任務自動化，機器學習模型無縫整合，讓不具備 AI 專業背景的藥物化學家也能輕鬆使用

CADD 工具視覺化

Olaparib（奧拉帕尼）的形狀比對（Shape-based alignment）結果 — 用於骨架跳躍，從已知活性分子出發找到形狀相似但結構新穎的候選分子

分子對接（Molecular Docking）工作流程結果視覺化 — 候選分子與靶點蛋白的結合模式與對接評分

案例研究：Tankyrase 抑制劑

Tankyrase 抑制劑的設計與優化 — 從已知的黃酮類抑制劑出發，透過 AI 生成、篩選與優化發現新的候選分子

虛擬化合物庫的化學空間重疊分析 — 比較 3D 形狀搜索（綠色）與 2D 藥效團搜索（金色）的化學空間分布

藥效團（pharmacophore）搜索與化學空間探索的詳細結果 — 展示平台在大規模化合物篩選中的能力

藥物開發生命週期中的定位

開發階段	AIDDISON 角色
靶點確認後 / 虛擬篩選	從 600 億+ 化合物空間中篩選具有所需性質的候選分子
先導化合物鑑定	透過分子對接、形狀比對、藥效團搜索識別初始活性化合物
骨架跳躍	基於已知活性分子，發現結構新穎但藥理活性相似的分子，突破專利限制
先導化合物優化	利用 ADMET 預測與生成式模型優化候選分子的藥物性質
合成可行性評估	透過 SYNTHIA 整合，在設計階段即時評估分子的可合成性

技術規格

項目	規格
平台類型	SaaS（軟體即服務）
部署方式	雲端 Web 平台
安全認證	ISO 27001
化合物搜索空間	600 億+ 化合物
訓練數據	20+ 年藥物研發實驗驗證數據集
逆合成整合	SYNTHIA Retrosynthesis API
發布日期	2023 年 12 月
開發者	Merck KGaA, Darmstadt, Germany

應用領域

製藥業

加速藥物發現中的虛擬篩選、先導化合物鑑定與優化。

生物技術

為中小型生技公司提供企業級 AI 藥物發現能力，無需自建 AI 團隊。

委託研究機構（CRO）

為客戶快速執行虛擬篩選與候選分子評估。

學術機構

藥物化學、計算化學相關研究，降低 AI/ML 技術的學習門檻。

關鍵差異化優勢

設計 + 合成一體化

業界唯一同時解決「設計什麼分子」與「如何合成」的平台，透過 SYNTHIA 整合實現

600 億+ 化合物空間

搜索範圍遠超傳統化合物庫（通常為數百萬至數十億），大幅擴展藥物發現的可能性

20 年實驗驗證數據

基於經過實驗驗證的製藥 R&D 數據訓練，非僅從文獻或理論數據學習，確保預測品質

低學習門檻 + ISO 27001 安全

讓不具備 AI 專業背景的藥物化學家也能使用先進 AI/ML 工具，同時保護用戶智慧財產